婚外情有了孩子的处理方式是和婚生子女一样的，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则;已满两周岁的子女，抚养权由双方协商协商不成由法院判决;已满八周岁的，尊重孩子真实意愿。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》
第一千零七十一条第一款规定，非婚生子女享有与婚生子女同等的权利，任何组织或者个人不得加以危害和歧视。
第一千零八十四条第四、五、六款规定，离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。
已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。
子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。